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IPEN-DOC 09151
- TORNIERI, PAULA H.
.
Expressao de endostatina em fibroblastos murinos para tratamento de tumores solidos.
2003.
Dissertacao (Mestrado) -
Instituto de Pesquisas Energeticas e Nucleares - IPEN/CNEN-SP,
Sao Paulo.
65 p.
Orientador: Ligia Ely Morganti Ferreira Dias.
Palavras-Chave: proteins; collagen; fibroblasts; dna-cloning; blood vessels; neoplasms
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IPEN-DOC 07344
- NOGUEIRA, G.E.C.
; - FERREIRA, A.
;- VIDAL, J.T.
. A nonuniform sampled coherent pulsed Doppler ultrasonic velocimeter with increased velocity range.
IEEE Transactions on Ultrasonics Ferroelectrics and Frequency Control,
v. 46,
n. 2,
p. 452-456,
1999.
Palavras-Chave: diagnostic techniques; pulse techniques; blood flow; blood vessels; blood; velocity; velocimeters; doppler effect; ultrasonic waves; pulses; frequency measurement
-
IPEN-DOC 07533
- LAMMOGLIA, PATRICIA
.
Elaboracao e implementacao de testes de controle de qualidade em equipamentos de angiografia por subtracao digital.
2001.
Dissertacao (Mestrado) -
Instituto de Pesquisas Energeticas e Nucleares - IPEN/CNEN-SP,
Sao Paulo.
sep.pag p.
Orientador: Linda Viola Ehlin Caldas.
DOI:
10.11606/D.85.2001.tde-23072002-091706
Abstract: Foram elaborados e implementados testes de controle de qualidade em equipamentos de angiografia por subtração digital. Estes testes foram baseados em normas nacionais e internacionais e foram implementados em cinco equipamentos de três instituições diferentes. Estes testes avaliam os parâmetros de desempenho dos equipamentos e são utilizados para a determinação da taxa de kerma no ar na entrada da pele do paciente e do corpo clínico. Os testes foram realizados utilizando dispositivos, simuladores de pacientes e câmaras de ionização. Os testes convencionais e do sistema de subtração digital indicaram que os equipamentos avaliados encontravam-se em bom estado de desempenho. Os testes para verificação da taxa de kerma no ar indicaram que um dos equipamentos avaliados apresentou altas taxas de kerma no ar na entrada da pele do paciente em modo fluoroscopia. Este problema foi notificado, e as devidas providências foram imediatamente tomadas pela gerência do hospital.
Palavras-Chave: biomedical radiography; blood vessels; equipment; quality control; performance testing; kerma; phantoms; ionization chambers
-
IPEN-DOC 09999
- CHAMBI, ROSA M.C.
.
Expressao de endostatina murina recombinante em celulas de ovario de hamster chines.
2004.
Dissertacao (Mestrado) -
Instituto de Pesquisas Energeticas e Nucleares - IPEN/CNEN-SP,
Sao Paulo.
59 p.
Orientador: Ligia Ely Morganti Ferreira Dias.
Palavras-Chave: collagen; proteins; recombinant dna; cho cells; gene amplification; blood vessels; molecular biology
-
IPEN-DOC 08064
- LAMMOGLIA, P.
;- FURQUIM, T.A.C.
;- COSTA, P.R.
;- CALDAS, L.V.E.
. Testes de controle de qualidade em equipamentos de Angiografia por Subtracao Digital - resultados preliminares.
In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ENGENHARIA BIOMEDICA,
2000, Florianopolis, SC. Anais...
2000.
Palavras-Chave: biomedical radiography; blood vessels; digital systems; quality control; fluoroscopy; image intensifiers; phantoms; ionization chambers
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IPEN-DOC 22017
- SILVA, NATAN V. da
.
Produção e estudo de atividade antiangiogênica de proteínas de fusão endostatina-domínio BH3 das proteínas pró-apoptóticas PUMA e BIM
/ Production and study of the antiangiogenic activity of the fusion proteins endostatin-BH3 domain of the pro-apoptotic proteins PUMA and BIM
.
2015.
Dissertação (Mestrado em Tecnologia Nuclear) -
Instituto de Pesquisas Energéticas e Nucleares - IPEN-CNEN/SP,
São Paulo.
38 p.
Orientador: Ligia Ely Morganti Ferreira Dias.
DOI:
10.11606/D.85.2016.tde-23032016-155417
Abstract: A endostatina (ES) é uma proteína inibidora da angiogênese, com ação específica sobre células endoteliais em proliferação, utilizada para tratamento de tumores sólidos. No entanto, o elevado efeito antitumoral da ES observado em animais não é reproduzido em humanos. Com o intuito de potencializar a eficácia terapêutica da ES, produzimos duas proteínas híbridas com dois domínios funcionais. O primeiro domínio é a ES, que apresenta especificidade por células endoteliais ativadas, dirigindo estas proteínas de fusão às células endoteliais em proliferação, promovendo sua internalização e seu efeito inibitório. Como segundo domínio funcional utilizamos os domínios BH3 próapoptóticos de duas proteínas BH3-only com o objetivo de promover a liberação de citocromo C e desencadear o processo de apoptose, aumentando a ação antiangiogênica da ES. Neste trabalho, foram desenhadas duas proteínas de fusão que contêm o domínio BH3 das potentes proteínas pró apoptóticas PUMA e BIM (ES-PUMA e ES-BIM), que deveriam apresentar efeito antiangiogênico potencializado em relação à ES selvagem. A inserção dos fragmentos de DNA codificantes para os domínios BH3 de PUMA e BIM no vetor contendo o gene da ES (pET-ES) foram realizadas por mutagênese sítiodirigida. Estas proteínas de fusão recombinantes foram expressas como corpos de inclusão em E.coli, renaturadas utilizando processo que utiliza alta pressão e purificadas em resina de afinidade por heparina. O tratamento de células endoteliais com as proteínas ES-PUMA e ES-BIM não levou à queda de viabilidade em ensaio de MTS ou de apoptose avaliado por citometria de fluxo, em comparação com os resultados obtidos pelo tratamento com ES.
Palavras-Chave: angiogenesis; blood vessels; carcinogenesis; growth factors; neoplasms; tumor cells; collagen; resins; polysaccharides; protein engineering; reticuloendothelial system; counting techniques; molecular biology; biotechnology; medical examinations; medical surveillance; diagnosis
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IPEN-DOC 26419
- PRETTO, LUCAS R. de
; - MOULT, ERIC M.
;- ALIBHAI, A.Y.
;- CARRASCO-ZEVALLOS, OSCAR M.
;- CHEN, SIYU
;- LEE, BYUNGKUN
;- WITKIN, ANDRE J.
;- BAUMAL, CAROLINE R.
;- REICHEL, ELIAS
;- FREITAS, ANDERSON Z. de
; - DUKER, JAY S.
;- WAHEED, NADIA K.
;- FUJIMOTO, JAMES G.
. Controlling for artifacts in widefield optical coherence tomography angiography measurements of non-perfusion area. Scientific Reports, v. 9, p. 1-15, 2019. DOI: 10.1038/s41598-019-43958-1 Abstract: The recent clinical adoption of optical coherence tomography (OCT) angiography (OCTA) has enabled non-invasive, volumetric visualization of ocular vasculature at micron-scale resolutions. Initially limited to 3 mm × 3 mm and 6 mm × 6 mm fields-of-view (FOV), commercial OCTA systems now offer 12 mm × 12 mm, or larger, imaging fields. While larger FOVs promise a more complete visualization of retinal disease, they also introduce new challenges to the accurate and reliable interpretation of OCTA data. In particular, because of vignetting, wide-field imaging increases occurrence of low-OCT-signal artifacts, which leads to thresholding and/or segmentation artifacts, complicating OCTA analysis. This study presents theoretical and case-based descriptions of the causes and effects of low-OCTsignal artifacts. Through these descriptions, we demonstrate that OCTA data interpretation can be ambiguous if performed without consulting corresponding OCT data. Furthermore, using wide-field non-perfusion analysis in diabetic retinopathy as a model widefield OCTA usage-case, we show how qualitative and quantitative analysis can be confounded by low-OCT-signal artifacts. Based on these results, we suggest methods and best-practices for preventing and managing low-OCT-signal artifacts, thereby reducing errors in OCTA quantitative analysis of non-perfusion and improving reproducibility. These methods promise to be especially important for longitudinal studies detecting progression and response to therapy.Palavras-Chave: ophthalmology; retina; biomedical radiography; tomography; vascular diseases; optical equipment; coherent radiation; images; blood vessels; beam scanners
-
IPEN-DOC 25947
- CONTATORI, CAROLINA G. de S.
.
Efeitos do laser de baixa potência de emissão infravermelha (λ=780nm) em células de melanoma murino e humano
/ Effects of near infrared laser (λ = 780nm) on murine and human melanoma cells
.
2019.
Dissertação (Mestrado em Tecnologia Nuclear) -
Instituto de Pesquisas Energéticas e Nucleares - IPEN-CNEN/SP,
São Paulo.
74 p.
Orientador: Martha Simões Ribeiro.
DOI:
10.11606/D.85.2019.tde-30072019-132516
Abstract: O câncer de pele pode ser do tipo melanoma ou não melanoma, sendo comum em pessoas acima de 40 anos, de pele clara ou com doenças cutâneas prévias. A incidência do melanoma é baixa, porém, é considerado o mais agressivo e mortal devido ao seu alto poder metastático. A cirurgia ainda é a forma de tratamento mais empregada para a doença, sendo muito invasiva e, portanto, terapias coadjuvantes estão sendo empregadas a fim de melhorar a qualidade de vida dos pacientes, como o laser de baixa potência (LBP). Sabe-se que o LBP pode desencadear efeito bioestimulatório em culturas celulares crescidas sob déficit nutricional, porém em linhagens tumorais sua ação é controversa. Dessa forma, o objetivo desse estudo consiste em investigar os efeitos inibitórios do LBP no comportamento de células de melanoma murino B16F10 e humano SKMEL 37 utilizando um laser de emissão infravermelha (λ = 780 nm) com diferentes densidades de energia. Foram adotados 4 grupos experimentais: G0 (grupo controle), G30 (30 J.cm-2), G90 (90 J.cm-2) e G150 (150 J.cm-2) a fim de verificar a viabilidade celular, através do ensaio de MTT e vermelho neutro; o comportamento de invasão celular, obtido através do ensaio de invasão transwell; e o papel do LBP na expressão do fator de crescimento endotelial vascular (VEGF), verificado através do ensaio imunoenzimático ELISA. Os resultados mostraram que a densidade de energia de 30 J.cm-2 estimulou o comportamento de invasão da linhagem celular B16F10. Por outro lado, o LBP não exerceu influência na expressão do fator de crescimento endotelial vascular, na viabilidade celular, e na atividade mitocondrial de ambas as linhagens celulares, em nenhuma das densidades de energia utilizadas, em comparação ao controle.
Palavras-Chave: neoplasms; melanomas; animal cells; reticuloendothelial system; protein engineering; blood vessels; mitochondria; cardiovascular system; skin diseases; infrared radiation; lasers; low level counting; biological effects
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IPEN-DOC 26682
- ISHIBAZAWA, AKIHIRO
;- PRETTO, LUCAS R. de
; - ALIBHAI, A. YASIN
;- MOULT, ERIC M.
;- ARYA, MALVIKA
;- SOROUR, OSAMA
;- MEHTA, NIHAAL
;- BAUMAL, CAROLINE R.
;- WITKIN, ANDRE J.
;- YOSHIDA, AKITOSHI
;- DUKER, JAY S.
;- FUJIMOTO, JAMES G.
;- WAHEED, NADIA K.
. Retinal nonperfusion relationship to arteries or veins observed on widefield optical coherence tomography angiography in diabetic retinopathy. Investigative Ophthalmology & Visual Science, v. 60, n. 13, p. 4310-4318, 2019. DOI: 10.1167/iovs.19-26653 Abstract: PURPOSE. To evaluate whether retinal capillary nonperfusion is found predominantly adjacent to arteries or veins in eyes with diabetic retinopathy (DR). METHODS. Sixty-three eyes from 44 patients with proliferative DR (PDR) or non-PDR (NPDR) were included. Images (12 3 12-mm) foveal-centered optical coherence tomography (OCT) angiography (OCTA) images were taken using the Zeiss Plex Elite 9000. In 37 eyes, widefield montages with five fixation points were also obtained. A semiautomatic algorithm that detects nonperfusion in full-retina OCT slabs was developed, and the percentages of capillary nonperfusion within the total image area were calculated. Retinal arteries and veins were manually traced. Based on the shortest distance, nonperfusion pixels were labeled as either arterial-side or venous-side. Arterial-adjacent and venous-adjacent nonperfusion and the A/V ratio (arterial-adjacent nonperfusion divided by venous-adjacent nonperfusion) were quantified. RESULTS. Twenty-two eyes with moderate NPDR, 16 eyes with severe NPDR, and 25 eyes with PDR were scanned. Total nonperfusion area in PDR (median: 8.93%) was greater than in moderate NPDR (3.49%, P < 0.01). Arterial-adjacent nonperfusion was greater than venousadjacent nonperfusion for all stages of DR (P < 0.001). The median A/V ratios were 1.93 in moderate NPDR, 1.84 in severe NPDR, and 1.78 in PDR. The A/V ratio was negatively correlated with the total nonperfusion area (r ¼ 0.600, P < 0.0001). The results from the widefield montages showed similar patterns. CONCLUSIONS. OCTA images with arteries and veins traced allowed us to estimate the nonperfusion distribution. In DR, smaller nonperfusion tends to be arterial-adjacent, while larger nonperfusion tends toward veins.Palavras-Chave: tomography; optical modes; optical equipment; diabetes mellitus; blood vessels; ischemia; retina; veins
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O gerenciamento do Repositório está a cargo da Biblioteca do IPEN. Constam neste RI, até o presente momento 20.950 itens que tanto podem ser artigos de periódicos ou de eventos nacionais e internacionais, dissertações e teses, livros, capítulo de livros e relatórios técnicos. Para participar do RI-IPEN é necessário que pelo menos um dos autores tenha vínculo acadêmico ou funcional com o Instituto. Nesta primeira etapa de funcionamento do RI, a coleta das publicações é realizada periodicamente pela equipe da Biblioteca do IPEN, extraindo os dados das bases internacionais tais como a Web of Science, Scopus, INIS, SciElo além de verificar o Currículo Lattes. O RI-IPEN apresenta também um aspecto inovador no seu funcionamento. Por meio de metadados específicos ele está vinculado ao sistema de gerenciamento das atividades do Plano Diretor anual do IPEN (SIGEPI). Com o objetivo de fornecer dados numéricos para a elaboração dos indicadores da Produção Cientifica Institucional, disponibiliza uma tabela estatística registrando em tempo real a inserção de novos itens. Foi criado um metadado que contém um número único para cada integrante da comunidade científica do IPEN. Esse metadado se transformou em um filtro que ao ser acionado apresenta todos os trabalhos de um determinado autor independente das variáveis na forma de citação do seu nome.
A elaboração do projeto do RI do IPEN foi iniciado em novembro de 2013, colocado em operação interna em julho de 2014 e disponibilizado na Internet em junho de 2015. Utiliza o software livre Dspace, desenvolvido pelo Massachusetts Institute of Technology (MIT). Para descrição dos metadados adota o padrão Dublin Core. É compatível com o Protocolo de Arquivos Abertos (OAI) permitindo interoperabilidade com repositórios de âmbito nacional e internacional.
1. Portaria IPEN-CNEN/SP nº 387, que estabeleceu os princípios que nortearam a criação do RDI, clique aqui.
2. A experiência do Instituto de Pesquisas Energéticas e Nucleares (IPEN-CNEN/SP) na criação de um Repositório Digital Institucional – RDI, clique aqui.
O Repositório Digital do IPEN é um equipamento institucional de acesso aberto, criado com o objetivo de reunir, preservar, disponibilizar e conferir maior visibilidade à Produção Científica publicada pelo Instituto, desde sua criação em 1956.
Operando, inicialmente como uma base de dados referencial o Repositório foi disponibilizado na atual plataforma, em junho de 2015. No Repositório está disponível o acesso ao conteúdo digital de artigos de periódicos, eventos, nacionais e internacionais, livros, capítulos, dissertações, teses e relatórios técnicos.
A elaboração do projeto do RI do IPEN foi iniciado em novembro de 2013, colocado em operação interna em julho de 2014 e disponibilizado na Internet em junho de 2015. Utiliza o software livre Dspace, desenvolvido pelo Massachusetts Institute of Technology (MIT). Para descrição dos metadados adota o padrão Dublin Core. É compatível com o Protocolo de Arquivos Abertos (OAI) permitindo interoperabilidade com repositórios de âmbito nacional e internacional.
O gerenciamento do Repositório está a cargo da Biblioteca do IPEN. Constam neste RI, até o presente momento 20.950 itens que tanto podem ser artigos de periódicos ou de eventos nacionais e internacionais, dissertações e teses, livros, capítulo de livros e relatórios técnicos. Para participar do RI-IPEN é necessário que pelo menos um dos autores tenha vínculo acadêmico ou funcional com o Instituto. Nesta primeira etapa de funcionamento do RI, a coleta das publicações é realizada periodicamente pela equipe da Biblioteca do IPEN, extraindo os dados das bases internacionais tais como a Web of Science, Scopus, INIS, SciElo além de verificar o Currículo Lattes. O RI-IPEN apresenta também um aspecto inovador no seu funcionamento. Por meio de metadados específicos ele está vinculado ao sistema de gerenciamento das atividades do Plano Diretor anual do IPEN (SIGEPI). Com o objetivo de fornecer dados numéricos para a elaboração dos indicadores da Produção Cientifica Institucional, disponibiliza uma tabela estatística registrando em tempo real a inserção de novos itens. Foi criado um metadado que contém um número único para cada integrante da comunidade científica do IPEN. Esse metadado se transformou em um filtro que ao ser acionado apresenta todos os trabalhos de um determinado autor independente das variáveis na forma de citação do seu nome.