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IPEN-DOC 00738
- ROGERO, JOSE R.
.
Toxinas do veneno de crotalus durissus terrificus. Interação proteína-proteína e cinética de troca isotópica hidrogênio-trício.
1978.
Tese (Doutoramento) -
Instituto de Quimica, Universidade de Sao Paulo - IQ/USP,
Sao Paulo.
114 p.
Orientador: Jose Moura Goncalves.
Palavras-Chave: hydrogen; interactions; isotopic exchange; proteins; snakes; toxins; tritium; venoms
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IPEN-DOC 12241
- SABATO, SUSY F.
; - NAKAMURAKARE, N.
;- SOBRAL, P.J.A.
. Mechanical and thermal properties of irradiated films based on tilapia (Oreochromis niloticus) proteins. Radiation Physics and Chemistry, v. 76, n. 11-12, p. 1862-1865, 2007.Palavras-Chave: electron beams; radiations; fishes; proteins; films; mechanical properties; thermodynamic properties
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IPEN-DOC 20113
- ALMEIDA, B.E.
; - DAMIANI, R.
; - OLIVEIRA, J.E.
; - DALMORA, S.L.
;- TORJESEN, P.A.
;- BARTOLINI, P.
; - RIBELA, M.T.C.P.
. Reversed-phase performance liquid chromatography as an alternative to animal bioassay for human thyrotropin potency determination.
Analytical Methods,
v. 6,
p. 6688-6694,
2014.
Palavras-Chave: hormones; bioassay; in vivo; mice; activity levels; recombinant dna; proteins; high-performance liquid chromatography; tsh; physical chemistry
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IPEN-DOC 20095
- RODRIGUES, D.
; - FARINHA-ARCIERI, L.E.
;- VENTURA, A.M.
;- CHURA-CHAMBI, R.M.
; - MALAVASI, R.V.
;- LEMKE, L.S.
;- GUIMARAES, J.S.
;- HO, P.L.
;- MORGANTI, L.
. Effect of pressure on refolding of recombinant pentameric cholera toxin B.
Journal of Biotechnology,
v. 173,
p. 98-105,
2014.
Palavras-Chave: proteins; cholera; toxins; escherichia coli; vaccines; pressure range; inclusions
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IPEN-DOC 22640
- ANTEBI, URI
; - MATHOR, MONICA B.
; - SILVA, ANDRE F. da
;- GUIMARAES, RODRIGO P.
;- HONDA, EMERSON K.
. Effects of ionizing radiation on proteins in lyophilized or frozen demineralized / Efeitos da radiação ionizante nas proteinas presentes em ossos humanos desmineralizados liofilizados ou congelados. Revista Brasileira de Ortopedia, v. 51, n. 2, p. 224-230, 2016. DOI: 10.1016/j.rboe.2016.02.006 Abstract: The aim was to study the effects of application of ionizing radiation (gamma andelectrons) as sterilizing agents at doses of 15 kGy, 25 kGy and 50 kGy, on lyophilized or frozendemineralized bone tissue for use in transplants.Methods: Five human femoral diaphyses from different donors of musculoskeletal tissuewere demineralized and preserved as lyophilized or frozen at −80◦C. The samples weredivided into two groups: non-irradiated (control) and irradiated by means of gamma rays oran electron beam. The bone proteins were extracted and used to determine the concentra-tions of total protein and BMP 2 and 7.Results: Decreases in total protein and BMP 2 and 7 concentrations were observed. Thedecreases in total protein concentrations, in comparison with the respective control groups,were significant in the lyophilized and frozen samples that were irradiated at a dose of50 kGy of gamma radiation and electron beam, with reductions of more than 30%. Signifi-cant decreases in the levels of BMP 2 and 7 were also observed at higher doses and especiallythrough use of the electron beam.Conclusion: The reductions in the concentrations of total proteins and osteoinductive pro-teins (BMP 2 and 7) were related to the radiation dose, i.e. they increased with higher dosesof ionizing radiation type and the type of bone preservation. The largest reductions in con-centrations were observed in the bones irradiated by means of an electron beam and at adose of 50 kGy. However, this type of radiation and this high dose are not usual practices forsterilization of bone tissuePalavras-Chave: skeleton; ionizing radiations; animal tissues; proteins; radiation effects; demineralization; gamma radiation; electrons; sterilization; transplants
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IPEN-DOC 09151
- TORNIERI, PAULA H.
.
Expressao de endostatina em fibroblastos murinos para tratamento de tumores solidos.
2003.
Dissertacao (Mestrado) -
Instituto de Pesquisas Energeticas e Nucleares - IPEN/CNEN-SP,
Sao Paulo.
65 p.
Orientador: Ligia Ely Morganti Ferreira Dias.
Palavras-Chave: proteins; collagen; fibroblasts; dna-cloning; blood vessels; neoplasms
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IPEN-DOC 18592
- LEMKE, LAURA S.
.
Renaturação sob alta pressão hidrostítica de tiorredoxinas de Xylella fastidiosa
/ Renaturation under high hidrostatic pressure of thioredoxins of Xylella fastidiosa
.
2012.
Dissertação (Mestrado) -
Instituto de Pesquisas Energeticas e Nucleares - IPEN-CNEN/SP,
São Paulo.
77 p.
Orientador: Ligia Ely Morganti Ferreira Dias.
DOI:
10.11606/D.85.2012.tde-06032013-132235
Abstract: Muitas das proteínas de valor biomédico relevante são encontradas em baixas concentrações em suas fontes nativas. O alto nível de expressão de proteínas recombinantes em E. coli, muitas vezes gera o acúmulo de proteínas como agregados insolúveis no citoplasma e/ou periplasma da bactéria, denominados de corpos de inclusão (CI). A alta pressão tem sido amplamente utilizada no estudo da conformação das proteínas,ela modula as interações proteína-proteína e proteína-solvente através de mudanças no volume das mesmas, promovendo a entrada de água nas cavidades não expostas da molécula e promovendo hidratação e solubilização dos agregados. O presente trabalho teve como objetivo a renaturação de proteínas recombinantes expressas como CI em Escherichia coli usando alta pressão hidrostática como condição branda de dissociação dos agregados. As tiorredoxinas TsnC e TrxA, a proteína YbbN e a proteína comigratória com bacterioferritina (Bcp), todas de Xylella fastidiosa, foram estudadas neste trabalho. As condições de renaturação foram otimizadas, utilizando-se diferentes proporções do par redox, concentrações de GdnHCl, presença de aditivos e esquemas de descompressão. Para a quantificação e análise da eficácia do processo de renaturação das proteínas sob pressão foram utilizadas as técnicas de microscopia eletrônica de varredura dos CI e de SDS-PAGE, e ensaios de atividade enzimática das proteínas. A TsnC foi renaturada em Tris HCl 50 mM com proporção de 10GSH:1GSSG em concentração final de 10 mM, 0,75 M GdnHCl, na presença de 0,5 M de Triton-X e a pressão utilizada foi de 2,4 kbar por 1 hora e 30 minutos seguida de descompressão direta e incubação por 16 horas em pressão atmosférica. O rendimento final de obtenção de TsnC solúvel foi altíssimo, de até 89,9%. A renaturação de proteína YbbN, nunca antes descrita, foi obtida em tampão de renaturação Tris HCl 50 mM, na presença de 0,5 M de L-Arginina e a pressão utilizada foi de 2,4 kbar por 1 hora e 30 minutos seguida de descompressão direta e incubação por 16 horas em pressão atmosférica. A proteína YbbN, que apresentou atividade de tioredoxina, foi renaturada com rendimento de até 98% a partir da proteína insolúvel nos CI. Foi possível a solubilização da tiorredoxina TrxA e Bcp sob alta pressão hidrostática em tampão de renaturação Tris HCl 50 mM, utilizando diferentes proporções do par redox na concentração final de 10 mM e 1,5 M de GdnHCl, porém não foi possível obter a atividade biológicas destas proteínas. Mostramos também que a L-Arginina apresenta efeito auxiliar na solubilização dos CI induzida pela alta pressão, e ao mesmo tempo se mostrou altamente protetora contra a inativação da atividade da YbbN promovida pela incubação em altas temperaturas, o que sugere que a presença deste aminoácido pode ter alta aplicabilidade juntamente com a aplicação de altas pressões para elevar os rendimentos de renaturação de proteínas recombinantes a partir de CI.
Palavras-Chave: proteins; bacterial diseases; microorganisms; hydrostatics; pressurization; scanning electron microscopy
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IPEN-DOC 20075
- VARCA, GUSTAVO H.C.
; - FERRAZ, CAROLINE C.
; - LOPES, PATRICIA S.
;- MATHOR, MONICA B.
; - GRASSELLI, MARIANO
;- LUGAO, ADEMAR B.
. Radio-synthesized protein-based nanopparticles for biomedical purposes.
Radiation Physics and Chemistry,
v. 94,
p. 181-185,
2014.
Palavras-Chave: proteins; papain; nanostructures; particles; ionizing radiations; enzymes; cross-linking
-
IPEN-DOC 18181
- QUEIROZ, RODRIGO G.
.
Componentes derivados de venenos de serpentes com ação antitumoral em células de melanoma murino
/ Snake venoms components with antitumor activity in murine melanoma cells
.
2012.
Tese (Doutoramento) -
Instituto de Pesquisas Energeticas e Nucleares - IPEN-CNEN/SP,
São Paulo.
91 p.
Orientador: Nanci do Nascimento.
DOI:
10.11606/T.85.2012.tde-24082012-133252
Abstract: Apesar dos constantes avanços no tratamento de câncer, essa doença continua sendo umas das principais causas de mortalidade no mundo todo, portanto, é imperativo que novas modalidades de tratamento sejam desenvolvidas. Venenos de serpentes causam uma variedade de efeitos biológicos, pois constituem uma mistura complexa de substâncias como disintegrinas, proteases (serino e metalo), fosfolipases A2, L-aminoácido oxidases entre outras. No presente trabalho pesquisou-se em alguns venenos de serpentes frações com atividade antitumoral, pois há relatos de compostos ofídicos que apresentam esta atividade. Após fracionamento de venenos de serpentes das famílias Viperidae e Elapidae foram feitas incubações das frações obtidas com células normais de fibroblasto L929 e de melanoma B16-F10. Os resultados mostraram que as frações do veneno da serpente Notechis ater niger apresentaram a maior especificidade e potencial antitumoral em células de melanoma murino B16-F10 que os demais venenos utilizados. Este achado, aliado ao fato de ser um veneno pouco explorado foram determinantes para que este veneno fosse selecionado para dar continuidade aos estudos. As frações citotóxicas deste veneno foram submetidas a análises para identificar e caracterizar os componentes que apresentaram esta atividade atitumoral. Ensaios de western-blot e zimografia sugerem que estas proteínas não pertencem à classe das metalo e serinoproteinases.
Palavras-Chave: snakes; venoms; biological repair; proteins; tumor cells; neoplasms; bioassay; boron 16; fluorine compounds; toxicity
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IPEN-DOC 11467
- UEDA, ERIC K.M.
.
Prolactina humana pseudofosforilada (S179D-hPRL) é um potente fator anti-angiogênico in vitro e in vivo.
2006.
Tese (Doutoramento) -
Instituto de Pesquisas Energeticas e Nucleares - IPEN-CNEN/SP,
Sao Paulo.
Orientador: Paolo Bartolini.
DOI:
10.11606/T.85.2006.tde-28052007-162443
Abstract: S179D prolactina (hPRL) é uma mímica molecular da prolactina humana fosforilada. Demonstrou-se que a S179D-hPRL era anti angiogênica nos ensaios de angiogênese baseados na membrana corialantóica de galinha e na córnea de camundongos. Investigações posteriores realizadas empregando modelos in vitro demonstraram que o tratamento com S179D-hPRL diminuiu o número de células viáveis, reduziu a formação de túbulos em Matrigel e interferiu com a migração e invasão da matriz extracelular. A análise dos fatores de crescimento de células endoteliais humanas tratadas com S179D-hPRL revelou: uma diminuição na expressão ou liberação da PRL endógena, da heme-oxigenase-1, do fator de crescimento de fibroblasto básico (bFGF) e um aumento na expressão de dois inibidores teciduais de metaloproteases. A S179D-hPRL também bloqueou a sinalização provocada por bFGF nessas células. Nós concluímos que essa mímica molecular do hormônio pituitário fosforilado é uma potente proteína anti-angiogênica, em parte devido á sua habilidade de reduzir o estímulo autócrino de fatores de crescimento de células endoteliais de cordão umbilical humano (HUVEC), por sua capacidade de bloquear a sinalização promovida pelo bFGF e por sua habilidade de interferir na migração endotelial. Também foi estudada a influência da S179D-hPRL na apoptose em células endoteliais humanas, empregando caspase-8 como um marcador da via extrínseca, e a liberação de citocromo C como um marcador da via intrínseca. As duas cascatas convergem na ativação da caspase-3, que cliva a fator de fragmentação de DNA (DFF45). Uma incubação de três dias com 50 ng/mL de S179D-hPRL quadruplicou o número de células apoptóticas; esse efeito duplicou-se com uma concentração de 100 ng/mL e atingiu um ápice com 500 ng/mL. A clivagem de DFF45 e da pro-caspase-8 foi detectado com 100 ng/mL. Citocromo C, porém, só foi observado com concentrações de 500 ng/mL. O regulador de ciclo celular p21 (um marcador pró-apoptótico) elevou-se com 100 ng/mL, enquanto que um incremento do supressor tumoral p53 necessitou três vezes o tempo de incubação e 500 ng/mL. A atividade do promotor de p21 foi máxima com 50 ng/mL do análogo de hPRL, enquanto que 500 ng/mL foram necessários para se visualizar uma alteração significativa na atividade do promotor de Bax (um indicador da atividade de p53). Como previamente demonstrado na literatura, S179D-hPRL bloqueou a fosforilação da quinase regulada extracelularmente (ERK) em resposta ao bFGF, mas também causou uma ativação tardia e prolongada da ERK. PD 98059 [inibidor específico da proteína quinase ativada por mitógeno (MAPkinase)] inibiu essa ativação tardia e sustentada assim como outros efeitos da S179D-hPRL, exceto aquele sobre a indução de p53 e ativação do promotor de Bax. Podemos concluir que baixas doses de S179D-hPRL bloqueiam a sinalização de ERK induzida por bFGF e concomitantemente ativam a ERK em um tempo diferente, resultando na elevação de p21 e ativando a via extrínseca de apoptose. Maiores tempos de incubação e concentração, entretanto, ativam a via intrínseca empregando uma cascata intracelular diferente. Esses achados sugerem que níveis circulantes de PRL fosforilada podem inibir a progressão do câncer e, portanto, S179D-hPRL poderia ser um agente anti-angiogênico útil na terapêutica.
Palavras-Chave: lth; phosphorylation; peptide hormones; cell proliferation; neoplasms; cell differentiation; polypeptides; endothelium; apoptosis; growth factors; receptors; antigens; in vitro; in vivo; proteins
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O gerenciamento do Repositório está a cargo da Biblioteca do IPEN. Constam neste RI, até o presente momento 20.950 itens que tanto podem ser artigos de periódicos ou de eventos nacionais e internacionais, dissertações e teses, livros, capítulo de livros e relatórios técnicos. Para participar do RI-IPEN é necessário que pelo menos um dos autores tenha vínculo acadêmico ou funcional com o Instituto. Nesta primeira etapa de funcionamento do RI, a coleta das publicações é realizada periodicamente pela equipe da Biblioteca do IPEN, extraindo os dados das bases internacionais tais como a Web of Science, Scopus, INIS, SciElo além de verificar o Currículo Lattes. O RI-IPEN apresenta também um aspecto inovador no seu funcionamento. Por meio de metadados específicos ele está vinculado ao sistema de gerenciamento das atividades do Plano Diretor anual do IPEN (SIGEPI). Com o objetivo de fornecer dados numéricos para a elaboração dos indicadores da Produção Cientifica Institucional, disponibiliza uma tabela estatística registrando em tempo real a inserção de novos itens. Foi criado um metadado que contém um número único para cada integrante da comunidade científica do IPEN. Esse metadado se transformou em um filtro que ao ser acionado apresenta todos os trabalhos de um determinado autor independente das variáveis na forma de citação do seu nome.
A elaboração do projeto do RI do IPEN foi iniciado em novembro de 2013, colocado em operação interna em julho de 2014 e disponibilizado na Internet em junho de 2015. Utiliza o software livre Dspace, desenvolvido pelo Massachusetts Institute of Technology (MIT). Para descrição dos metadados adota o padrão Dublin Core. É compatível com o Protocolo de Arquivos Abertos (OAI) permitindo interoperabilidade com repositórios de âmbito nacional e internacional.
1. Portaria IPEN-CNEN/SP nº 387, que estabeleceu os princípios que nortearam a criação do RDI, clique aqui.
2. A experiência do Instituto de Pesquisas Energéticas e Nucleares (IPEN-CNEN/SP) na criação de um Repositório Digital Institucional – RDI, clique aqui.
O Repositório Digital do IPEN é um equipamento institucional de acesso aberto, criado com o objetivo de reunir, preservar, disponibilizar e conferir maior visibilidade à Produção Científica publicada pelo Instituto, desde sua criação em 1956.
Operando, inicialmente como uma base de dados referencial o Repositório foi disponibilizado na atual plataforma, em junho de 2015. No Repositório está disponível o acesso ao conteúdo digital de artigos de periódicos, eventos, nacionais e internacionais, livros, capítulos, dissertações, teses e relatórios técnicos.
A elaboração do projeto do RI do IPEN foi iniciado em novembro de 2013, colocado em operação interna em julho de 2014 e disponibilizado na Internet em junho de 2015. Utiliza o software livre Dspace, desenvolvido pelo Massachusetts Institute of Technology (MIT). Para descrição dos metadados adota o padrão Dublin Core. É compatível com o Protocolo de Arquivos Abertos (OAI) permitindo interoperabilidade com repositórios de âmbito nacional e internacional.
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